Dans les deux dernières décennies, la Guinée-Bissau a fait face à d’importants troubles politiques avec des coups d’Etat successifs et des confrontations récurrentes entre les autorités politiques et l’armée, de même que dans la sphere politique. Le dysfonctionnement de l’Etat a un impact négatif important sur la société plus large, de même que sur le soutien international à la société civile, empêchant une consolidation de la paix et un développement durables. En 2007, Interpeace a lancé un programme de consolidation de la paix en collaboration avec son partenaire local, Voz di PazAu travers d’un processus de consultation nationale, celui-ci a demandé à plus de 6000 Bissau-Guinéens d’identifier les principaux obstacles à une paix durable dans le pays. Ces personnes ont mentionné le manque d’institutions étatiques efficaces, l’instabilité politique et institutionnelle, l’exclusion sociale et une culture de dialogue insuffisante comme certaines des raisons profondes de conflit. Comme résultat de cette étude, le programme oeuvre actuellement sur la bonne gouvernance de même que sur la prévention et la résolution des conflits.
Le programme pays d'Interpeace en Guinée-Bissau a pour mission générale de contribuer à la réappropriation d'un contrat social plus inclusif et fiable, favorisant une société plus pacifique. Pour atteindre cet objectif et garantir la pertinence et l’appropriation des processus et des résultats, Interpeace collabore étroitement avec Voz di Paz, une organisation non gouvernementale bissau-guinéenne indépendante dédiée à la consolidation de la paix, impliquant à la fois les citoyens et les institutions nationales. Le programme repose sur trois piliers fondamentaux guidant les activités : la création de services sociaux de base plus inclusifs et accessibles (SSB), la mise en place de processus de prévention et de gestion des conflits plus informés et efficaces, et enfin, le renforcement d'une relation de responsabilité plus solide entre les institutions et les citoyens, en mettant particulièrement l'accent sur la jeunesse et les femmes.